蚕蜂与野生动物保护论文_基于家蚕转录组测序的

文章摘要:本研究对家蚕中肠、脂肪体进行转录组测序，分析SSR位点的分布规律和特征。结果表明，从17 915个Unigene中共检测到1 339个SSR位点，分布在960个Unigene中。SSR位点的基序长度以1 bp为主，随着基序长度的增加，SSR位点数量逐渐减少，SSR位点间的距离和平均长度逐渐增加。家蚕SSR单核苷酸基序类型以A/T为主，占总基序数量的53.10%。重复次数最多的SSR位点数量主要集中在5～12次，占总SSR位点数的87.60%，其中单核苷酸重复10次的SSR位点最多，共有368个。家蚕转录组SSR基序长度分布范围为10～688 bp，高度多态性SSR位点（长度≥ 20 bp）有253个，占比18.89%。960个Unigene中分别有125、122个在GO、KEGG数据库中得到功能注释，主要包括蛋白结合通路、DNA结合通路、剪接体、代谢途径等通路。随机选择20对EST-SSR引物进行验证，发现19条引物扩增成功。

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项目基金:《分子科学学报》 网址: http://www.fzkxxbzz.cn/qikandaodu/2022/0119/1496.html