一文带您掌握MET驱动突变实体瘤分子诊断及靶向

受体酪氨酸激酶c-MET(以下简称MET)的功能失调已被证实是肿瘤发生的驱动因素。与许多其他原癌基因相比，MET的显著特点是三种不同类型的基因突变均可导致肿瘤的发生，包括扩增、突变和融合等。随着MET驱动突变癌症的诊断和治疗的迅速发展，《自然评论临床肿瘤学》（Nature Reviews Clinical Oncology）发表一篇关于MET基因的综述文章，系统阐述了MET驱动突变癌症的临床特征、诊断策略和靶向治疗方案1。

一、MET扩增

MET扩增即MET拷贝数扩增，包括整体染色体重复和局部区域基因的重复整体染色体重复即多倍体（polysomy）肿瘤细胞中出现多条7号染色体，多倍体在生物学中不能作为驱动基因。扩增是局部或区域基因的重复，断裂-融合-桥连机制是导致基因扩增的主要原因。与多倍体比较，MET扩增可能作为驱动基因，也是EGFR-TKI耐药的主要机制之一。MET基因拷贝数为连续变量，阳性阈值的定义会影响发生率、与其他基因亚型重叠率，及作为MET抑制剂疗效预测指标的能力。如下介绍MET扩增的诊断、临床特征和治疗等。

|?ET扩增检测

MET扩增可使用多种技术检测，包括荧光原位杂交（FISH）、实时定量PCR（qRT PCR）和二代测序（NGS）（见图1）。

荧光原位杂交（FISH）

FISH是一种常用的检测技术，其基本原理是利用荧光基团偶联标记的DNA探针来识别特定序列的基因组区域，常用于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片标本的检测。当待探测的基因组序列暴露于荧光标记的探针后，会发出相应颜色的荧光。荧光信号的数量则代表了了基因的拷贝数。

FISH主要有两种主要方式来检测MET扩增。第一种方法直接测定MET基因拷贝数(GCN)。目前临床研究采用最多的是Cappuzzo标准，即平均每个细胞有5条及其以上MET基因拷贝数(MET GCN ≥5)可视为MET扩增，也有其他学者建议平均拷贝数≥6个甚至15个才能定义为MET扩增。遗憾的是这种通过拷贝数来确定扩增的方法并不能区分是多倍体还是局部扩增。第二种方法将MET/CEP7≥2.0作为MET扩增标准，这是目前最广为接受的标准。也有学者根据MET/CEP7值将扩增程度分为三组：低度扩增(1.8 - 2.2)、中度扩增(2.2 -5)和高度扩增组(≥5)。

二代测序（NGS）

与适用于FISH的标准相似，对于MET扩增的单一定义没有达成共识。目前大部分平台均使用读取深度（read depth）测定法，这种方法基于读长深度的信号与样本中染色体片段的拷贝数成比例的原理，并使用一些生物信息学方法进行计算，然而在敏感性和特异性上还是有一定局限。有的平台还会使用同一患者来源的良性组织或者血液样本作为对照以进一步提高敏感度，NGS的优势在于除了能够同时评估数百个基因的变异外，还具有高分辨率和从众多的复制染色体中识别局部基因扩增的能力。临床上有两种基于NGS的检测方法：基于扩增子的NGS和基于捕获的NGS技术（见图1a、1b）。

图1.MET扩增肿瘤诊断

|?临床病理特征

原发MET扩增

在多种实体瘤中都发现有原发MET扩增，根据肿瘤基因组计划（TCGA）和cBioPortal数据库提供的数据，MET扩增比较典型的有非小细胞肺癌(NSCLC) ，检出率约＜1-5%；胃癌中约＜1-10%；大约2-4%的结肠癌（CRCs），13%左右的I型肾乳头状癌(PRCCs)和3%左右的II型肾乳头状癌也检出MET扩增，在食管癌和肝细胞癌中检出比例较低。在许多恶性肿瘤中MET扩增意味着预后不良。研究发现NSCLC细胞MET扩增度越高，肿瘤的MET驱动依赖性越强。MET高度扩增 (MET /CEP7 ≥5，FISH法)的 NSCLC患者，很少合并其他致癌基因的驱动改变（比如EGFR突变或者ALK融合），而在MET低度扩增（MET / CEP7 ≥1.8 , ≤2.2，FISH法）和中度扩增 （MET / CEP7>2.2 ，<5，FISH法）的患者中，更多合并有其他驱动基因改变（MET高，中，低度扩增合并其他驱动基因改变比例分别为0%，52%，50%）。

获得性MET扩增

MET扩增可以是原发的也可以是被其他原癌驱动基因（EGFR）次级激活，这也是EGFR等TKI耐药机制之一。根据不同的检测方法和平台提供的数据，在接受一到三代EGFR TKI靶向治疗后的NSCLC患者中大约5%~20%的比例会出现MET扩增。EGFR突变的肿瘤细胞可以绕开EGFR TKI（吉非替尼或者厄洛替尼等）作用的PI3K通路，激活MET这一旁路信号通路，而PI3K通路也可以通过MET介导的HER3信号通路进一步激活。MET扩增也被发现是ALK融合阳性NSCLC癌患者对ALK抑制剂耐药的机制之一。此外，在接受抗EGFR单克隆抗体治疗的结肠癌患者和接受EGFR和BRAF抑制剂联合治疗的BRAF V600E突变的结肠癌患者中也可检测到MET扩增。当患者接受EGFR TKI治疗后MET扩增的次级激活即可发生，这种激活也可以发生在肿瘤细胞的的亚克隆群中。当使用NGS检测的样本混合有MET扩增和非MET扩增的肿瘤细胞时该结果可能会低估MET的扩增程度，为了进一步提高准确度，建议可以联合FISH或者单细胞测序进行补充。

文章来源：《分子科学学报》 网址: http://www.fzkxxbzz.cn/zonghexinwen/2021/0226/575.html