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关于超二级结构、结构域、分子伴侣、等名词定
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摘要:在九版教材中,虽然把超二级结构从“二级结构”这一个段落,移到了“三级结构”这一章节进行叙述,但是这并未对其本身的分类造成影响。 结论: 超二级结构既不属于二级结构,
在九版教材中,虽然把超二级结构从“二级结构”这一个段落,移到了“三级结构”这一章节进行叙述,但是这并未对其本身的分类造成影响。
结论:
超二级结构既不属于二级结构,也不属于三级结构,在考试的时候应该按照独立的选项选取。
以上定义分类应当如下图:
理论解析:
1、基本定义
【二级结构】的定义:指蛋白质分子某一段肽链的局部空间结构,就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构像,主要的形式有α-螺旋,β-折叠,β-转角和Ω-环。
【三级结构】的定义:整条肽链中,全部氨基酸残基相对的空间位置,也就是整条 肽链所有原子在三维空间的排布位置
【超二级结构】的定义:在许多蛋白质分子中,可由2个或2个以上具有二级结构的肽段在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,称为超二级结构……经研究发现,α-螺旋之间、β-折叠之间以及α-螺旋与β-折叠之间的相互作用,主要是由非极性氨基酸残基参与的。
【结构域】的定义:结构域是三级结构层次上,具有独立结构与功能的区域,分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密且稳定的区域,并各行其功能,称为结构域。……若用限制性蛋白质水解,含多个结构域的蛋白质常分解出独立的结构域,而结构域也可看作是球状蛋白质的独立折叠单位,有较为独立的三维空间结构。
2、定义辨析
A.二级结构只是涉及主链骨架原子的相对空间位置,不涉及残基的构像,而多个二级结构组合在一起形成超二级时,就涉及了残基的相互作用和空间位置,所以超二级结构不符合二级结构的定义。
B. 但是超二级结构,也只是整条肽链上的一部分,而且又不像结构域一样可以单独的行使功能,所以它也没有达到三级结构的“整条肽链”的定义,所以它也不符合三级结构的定义。
C. 结构域是符合三级结构的定义的,因为它是可以独立行使功能,几个结构域被水解变成独立结构域后,就等于是一整条肽链,所以结构域属于三级结构
D.在三级结构这里介绍分子伴侣,是因为分子伴侣协助形成三级结构,而分子伴侣本身,可以是一个具有多个亚基,具有四级结构的蛋白质。所以分子伴侣并不属于三级结构,而其种类繁多,不建议在这里进行分子伴侣本身的分类介绍。
3、例证
不管是在过去把超二级结构放在二级结构段落,还是放在三级结构段落,真题中从未出现要求将其归类至二级或三级结构,都是作为单独选项出现。
例:【2005年113题】亮氨酸拉链属于蛋白质的——E
A. 一级机构
B. 二级结构
C. 三级结构
D. 四级机构
E. 模序结构
证:如果超二级结构属于二级或者三级,这里就会出现多个答案
【2010年的25题】下列选项中,属于蛋白质三级结构的是——C
A. α-螺旋
B. 无规则卷曲
C. 结构域
D. 锌指结构
证:如果超二级结构属于三级,这里就要把D也选上
【2012年的25题】下列结构中,属于蛋白质模序结构的是——C
A. α-螺旋
B. β-折叠
C. 锌指结构
D. 结构域
证:如果超二级结构属于二级,这里就要把AB也选上
【2016年的25题】“α-螺旋-β-转角-α-螺旋”属于的蛋白质结构是——C
A. 一级结构
B. 三级结构
C. 模体
D. 结构域
证:如果超二级结构属于三级,这里就要把B也选上
文章来源:《分子科学学报》 网址: http://www.fzkxxbzz.cn/zonghexinwen/2021/0406/778.html